1、抗菌。有广谱的抗菌作用，对各型痢疾杆菌的抑制作用尤强。在黄连解毒汤中黄连、黄柏的抗菌活性有协同作用。本品对结核杆菌、钩端螺旋体有较强的抑制和杀灭作用。本品对多种真菌、滴虫有显著的抑制作用。本品有抗流感病毒的作用，对乙肝表面抗原有明显的选择性抑制作用。其机制与其对细菌呼吸和RNA合成的强烈抑制有关，还能明显减少金葡菌毒素的生成并促进白细胞对细菌的吞噬。
2、降压。本品有显著的降压效果。其所含的多种生物碱如小檗碱、黄柏碱、巴马亭、药根碱、木兰花碱均有降压作用。其降压机制与阻断神经节、抑制血管中枢、抗交感神经介质有关。
3、对消化系统的影响。本品对实验性溃疡有显著的保护作用。其抗溃疡活性比小檗碱为强。黄柏、小檗碱、黄柏酮能兴奋肠平滑肌，促进肠管收缩；黄柏内酯能使肠管弛缓。本品对胰蛋白酶活性有显著的抑制功效，此作用与小檗碱无关。
4、利胆。本品有利胆作用，能促进胆汁和胰液分泌，促进胆红素排出。
5、镇咳作用。黄柏果实的挥发具有镇咳作用，其镇咳成分主要为香叶烯。并从挥发油中分得小檗碱和5，5'—二甲基糠醛醚。
6、泻火除蒸。用于治疗湿热泻痢、黄疸，黄檗易去除大肠湿热以治泻痢；还可治愈骨蒸劳热，盗汗，遗精症状，黄檗主入肾经可以退骨蒸，用来治疗阴虚火旺，潮热盗汗、腰酸遗精等症，如黄柏与知母、地黄、山药等配伍的知柏地黄丸。
7、解毒疗疮。黄柏内外用均可以用来治疗疮疡肿毒、湿疹瘙痒。
8、抗滴虫作用。黄柏煎剂，10%浓度与滴虫液1：1混和培养，对阴道毛滴虫有抑制作用。
9、抗肝炎作用。黄柏煎剂6.25-100%体外试验，对乙型肝炎抗原有抑制作用。黄柏碱对慢性肝炎有一定作用。
10、对免疫功能的影响。黄柏煎剂，100%浓度，0.3ml/只灌胃，连续7天，能增加小鼠脾空斑形成细胞数。
11、抗溃疡作用。
黄柏提取物（去小檗碱）100mg/kg 皮下注射，100、1000mg/kg 灌胃或皮内注射，对乙醇、阿斯匹林或幽门结扎诱发的大鼠胃溃疡有抑制作用。
黄柏在临床医疗上具有以下功效：
1、治疗急慢性肠炎、菌痢。
2、治疗结核病，包括肺结核、淋巴结结核、肾结核。
3、治疗急慢性尿路感染和肾盂肾炎。
4、治疗眼、耳、鼻、咽喉、皮肤之化脓性感染。
5、治疗炎、宫颈炎、前列腺炎、骨髓炎、皮肤湿疹、口腔溃疡等感染性、免疫性炎症。
6、用于湿热泻痢、湿热黄疸，以及小便淋沥涩痛、赤白带下，阴部肿痛、足膝肿痛、萎软无力等症。
7、用于热毒疮疡，湿疹等症。
8、用于阴虚发热，或梦遗滑精等症。黄柏除清实热外，尚能清虚热以疗潮热骨蒸，泻肾火以疗梦遗滑精，常合知母、地黄等同用。
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