3.4其他指标的测定
以上3个指标是当前最重要的经济性状，由于产仔数是采用记录的方式进行而不需要设备，在此不必赘述，但作为母系性状的选择这是最重要的指标之一，部分欧美发达国家考虑使用第5 天的活仔数来代替总产仔数的选择，完全靠母猪的母性来保障其存活，似乎有其道理，但其遗传力如何还有待研究。还有体尺指标、泌乳力指标、肉质指标、胴体指标等主要依靠记录的准确性和先进的设备。
测定数据在真实可靠的前提下，必须加以科学利用以发挥选育的效果。在我国主要存在两种方法，一是表型值多性状综合指数选择法，二是育种值多性状综合指数选择法。在环境条件统一规模较小的情况下，场内采用第一种方法仍然是有效的，一旦存在场间联系，跨世代，跨季节的情况下，第一种方法就显然不足了，目前大多数育种场都采用的是第二种方法，也称为遗传评估。
遗传评估，即育种值估计。是采用某种统计学方法将环境差异校正掉，以估计出每个性状的遗传水平，然后对多个性状根据其重要性和遗传力的大小制定一个选择指数，来综合评价种猪的价值。20 世纪70年代中期，美国首先利用这个方法进行公牛的遗传评估，到80年代中期，由于计算机技术进步和一些特殊计算方法的提出，使动物模型BLUP 法大规模运算成为可能，首先被加拿大用于猪的个体遗传评定嘲。其动物模型基本通式为：
y=xβ+z1α+z2u+e
其中y是性状观察值的向量，β是固定效应的向量，仪是动物个体的育种值（随机效应）向量，u 是其他随机效应的向量，x、z1和22分别是联系y与β、a和u的关联矩阵，e是随机残差效应向量。
目前在遗传进展方面取得具有显著成绩的国家主要是丹麦、加拿大、法国和美国等，如图4为加拿大3个品种达100 kg体重活体膘厚的遗传趋势，20年来取得了8 mm左右的进展。
5 遗传评估的发展趋势
动物模型BLUP是目前遗传评估较理想的方法，在实际育种中也发挥了很好的作用，但这个方法并非完美无缺，对于一些低遗传力性状、限性性状、难以度量的性状、阈性状（抗病性状）等，包括某场的饲料条件和疫病发生不稳定的情况下，该方法仍然不能获得理想的结果。
近几年来，各国遗传育种工作者在猪的QTL检测定位方面做了大量工作，取得了很多有意义的研究成果。根据Rothschild的总结，利用标记-QTL连锁分析的方法，已发现的QTL有：在染色体4、7和13上有与生长速度和背膘厚效应关联的QTL存在，对于肉质性状，PSE肉受位于第6染色体上的氟烷基因（兰尼定受体基因）的控制，染色体4和7上也有影响肉质性状的QTL存在，对于繁殖性状，多项研究证实在第8染色体上有影响排卵率和产仔
数的QTL存在等。利用候选基因法证明雌激素受体基因(ESR)对产仔数有显著影响，催乳素受体基因(PRLR)对产仔数也有显著影响[7]o因此利用QTL进行标记辅助选择逐步可行，对提高个体遗传评估的准确性、提高育种效率具有理想的应用前景。相对于动物模型BLUP，标记辅助选择的优越性主要体现在两个方面，一是提高遗传评估的准确性，尤其对于低遗传力性状、限性性状、抗病性状等，二是可以进行早期选择。在纯种群体中，利用标记辅助选择的方式主要有两种，一种是同时利用标记信息、表型信息和系谱信息对个体进行遗传评估，其分析方法可看成是对现在的动物模型BLUP的扩展[8-9]，其目的是提高评估的精确性。在这里一个很关键的问题是如何对标记信息和表型信息进行适当的加权，以期获得最佳的短期和长期遗传进展[l0]。另一种方式是进行两阶段选择，也就是充分利用分子遗传标记的测定不受年龄限制的优点，可以利用标记信息进行早期选择[11]。
另外，也有部分大型育种公司使用基因组选择的方法来选种，如HYBOR公司，保育猪进入测定舍时戴上专用耳标，采集其耳组织，然后提取DNA，每头测定几万个SNP，由电脑进行系统分析，然后采用基因组育种值BLUP综合指数(GBLUP)作为辅助选择的依据，这是目前认为最先进的育种技术手段。随着分子生物学技术以及早期测定技术的不断发展和成熟，种猪性能测定技术和评估方法将逐步发生改变，以获得更为准确的遗传进展满足养猪业的生产。
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